从根本上说，车裂商鞅是因为其功高震主，皇族视其为出头鸟，而秦王对他也并未给予足够的重视。从孝公生前的行为来看，他对商鞅的支持和信任是不容忽视的。

孝公在位期间，他让商鞅站在了变法与执法的最前沿，使其成为与士族大夫乃至太子、太傅正面冲突的中心。孝公明知道，自己死后，商鞅的处境将岌岌可危，身上的矛盾也将愈演愈烈。尽管如此，孝公仍为商鞅做了许多缓和矛盾的工作，如调解商鞅与太子之间的冲突等。尽管如此，孝公在谋划未来时，仍旧认为由继承者除去商鞅是有益无害的。一方面，这可以使那些在变法中受到打击的贵族得到些许安慰，缓和统治阶级内部的矛盾，提高惠文王的声望。另一方面，随着变法的完成，商鞅的历史使命已经完成，其存在对秦国的稳定不再具有积极作用。相反地，由于老臣的力量日渐壮大，且日益难以驾驭，商鞅的悲剧已然在所难免。孝公利用这一机会除去了商鞅，既震慑了老臣，也为秦国未来的发展铺平了道路。

另外有一种说法是孝公在临死前曾赋予商君一万精锐铁骑的兵权。然而商鞅为了秦国的安危主动放弃了这些部队，并在推荐了两位杰出的人才后慷慨赴死。商鞅的死使得年轻的秦王陷入了困境，夹在商鞅和老臣之间左右为难。更重要的是，商鞅的功绩过于显赫，令秦惠文王心生忌惮。这才是商鞅悲剧发生的根本原因所在。尽管商鞅之死令人扼腕叹息，但从长远来看，这对秦国的统一大业并未造成根本性的损害。